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在NCBI的數(shù)據(jù)權(quán)重選擇欄中選擇基因,在欄中填寫基因名稱,搜索目標(biāo)基因,點(diǎn)擊鏈接,會(huì)找到一些基本信息,包括物種、外顯子、編碼區(qū)等。

CDs是編碼區(qū)域

選擇需要比較的蛋白質(zhì)序列,在blast界面的enter query sequence下的大框中輸入。如果要與數(shù)據(jù)庫(kù)中的所有蛋白質(zhì)序列進(jìn)行比較,請(qǐng)?jiān)谙旅娴摹斑x擇搜索集”中選擇需要比較的數(shù)據(jù)庫(kù)。程序選擇中的對(duì)齊方式可根據(jù)個(gè)人需要進(jìn)行選擇。如果執(zhí)行成對(duì)對(duì)齊或多個(gè)序列對(duì)齊,請(qǐng)?jiān)凇拜斎氩樵冃蛄小笨蛑羞x擇“對(duì)齊兩個(gè)或多個(gè)序列”,在彈出框中輸入要對(duì)齊的序列,然后單擊“blast”。結(jié)果得分越高,同源性越高。E值為期望值,分值越低,同源性越高