caps標(biāo)記和indel標(biāo)記的區(qū)別？Indel（插入-缺失）標(biāo)記是指整個(gè)基因組中兩個(gè)親本之間的差異。與另一個(gè)親本相比，一個(gè)親本在基因組中有一定數(shù)量的核苷酸插入或缺失（Jander等人，2002）。根據(jù)

caps標(biāo)記和indel標(biāo)記的區(qū)別？

Indel（插入-缺失）標(biāo)記是指整個(gè)基因組中兩個(gè)親本之間的差異。與另一個(gè)親本相比，一個(gè)親本在基因組中有一定數(shù)量的核苷酸插入或缺失（Jander等人，2002）。根據(jù)基因組中的插入和缺失位點(diǎn)，設(shè)計(jì)了一些PCR引物對(duì)這些插入和缺失位點(diǎn)進(jìn)行擴(kuò)增，這些位點(diǎn)是InDel標(biāo)記。Caps標(biāo)記：SNP-PCR技術(shù)與RFLP技術(shù)相結(jié)合的分子標(biāo)記技術(shù)。簡(jiǎn)單的理解是SNP僅僅位于酶消化的位點(diǎn)。通過(guò)設(shè)計(jì)SNP位點(diǎn)的引物，將PCR得到的相應(yīng)產(chǎn)物片段經(jīng)酶切、電泳等步驟進(jìn)行消化，最后通過(guò)觀察不同條帶來(lái)判斷樣品的多態(tài)性。/Source network

在PubMed網(wǎng)站上找到相應(yīng)的基因mRNA序列，復(fù)制到引物設(shè)計(jì)軟件（如primer）軟件會(huì)設(shè)計(jì)不同的正負(fù)鏈引物，選擇合適的一個(gè)（得分較高），復(fù)制到PubMed網(wǎng)站，下拉列表中有一個(gè)PubMed blast。粘貼軟件設(shè)計(jì)的前后引物，通過(guò)搜索結(jié)果判斷引物是否正確、特異。