mega序列比對教程 序列比對需要一樣長么?在使用mega4.0對比的時候,需要序列一樣長么,如果需要那么怎么修改已測序列呢?
序列比對需要一樣長么?在使用mega4.0對比的時候,需要序列一樣長么,如果需要那么怎么修改已測序列呢?比較的時間應(yīng)該不同。在分析距離或系統(tǒng)樹時,可以選擇完全或成對刪除間隙/缺失數(shù)據(jù)項。應(yīng)該刪除引物序
序列比對需要一樣長么?在使用mega4.0對比的時候,需要序列一樣長么,如果需要那么怎么修改已測序列呢?
比較的時間應(yīng)該不同。在分析距離或系統(tǒng)樹時,可以選擇完全或成對刪除間隙/缺失數(shù)據(jù)項。
應(yīng)該刪除引物序列,因為它是我們自己設(shè)計的。
如何用MEGA7.0轉(zhuǎn)化為MEGA7.0可以用的格式?
Adobe Acrobat professional(專業(yè)版)或Adobe Acrobat standard(標(biāo)準(zhǔn)版)應(yīng)具有轉(zhuǎn)換和其他功能。但是,您下載的acrobat版本較低。必須先將其保存為TXT格式,然后再進行轉(zhuǎn)換。
如何用mega做多重序列比對分析?
Mega5用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹NJ和MP。鄰接距離矩陣(NJ)是構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹最常用的方法。它可以快速構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,也適合于大數(shù)據(jù)集的分析,可以快速進行自擴展測試,但缺點是分析的進化距離不能太大。最大簡約法在處理核苷酸替換時不需要距離法或似然法的假設(shè),因此在序列離散度較低時,最大簡約法可以得到更可靠的系統(tǒng)發(fā)育樹。