blast什么意思啊 如何使用ncbi核苷酸blast?
如何使用ncbi核苷酸blast?選擇要比較的蛋白質(zhì)序列,在blast界面的enterquerysequence下的大框中輸入。如果要與數(shù)據(jù)庫中的所有蛋白質(zhì)序列進(jìn)行比較,請從下面的“選擇”搜索集中選擇
如何使用ncbi核苷酸blast?
選擇要比較的蛋白質(zhì)序列,在blast界面的enterquerysequence下的大框中輸入。如果要與數(shù)據(jù)庫中的所有蛋白質(zhì)序列進(jìn)行比較,請從下面的“選擇”搜索集中選擇要比較的數(shù)據(jù)庫。程序選擇中的對齊方式可根據(jù)個(gè)人需要進(jìn)行選擇。如果執(zhí)行成對對齊或多個(gè)序列對齊,請?jiān)凇拜斎氩樵冃蛄小笨蛑羞x擇“對齊兩個(gè)或多個(gè)序列”,在彈出框中輸入要對齊的序列,然后單擊“blast”。結(jié)果得分越高,同源性越高。E值是期望值。分?jǐn)?shù)越低,同源性越高
blast(basic local alignment search tool)是一套在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫或DNA數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行相似性比較的分析工具。Blast程序可以快速地將相似序列與公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較。blast結(jié)果中的分?jǐn)?shù)是相似性的統(tǒng)計(jì)解釋。
NCBI有很多種,包括n-blast(核苷酸序列比對搜索)和p-blast(蛋白質(zhì)比對搜索)。此外,還有底漆噴砂等。
Blast比較一個(gè)或多個(gè)核酸或蛋白質(zhì)序列庫中的一個(gè)或多個(gè)序列(可以是任何形式的序列)。Blast還可以找到具有可以對齊的間隙的序列。Blast可以處理任意數(shù)量的序列,包括蛋白質(zhì)序列和會計(jì)序列。它也可以選擇多個(gè)數(shù)據(jù)庫,但數(shù)據(jù)庫必須是同一類型的,即蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫或核酸數(shù)據(jù)庫。查詢序列和數(shù)據(jù)庫可以是任意組合,要么核酸序列到蛋白質(zhì)庫進(jìn)行查詢,要么蛋白質(zhì)序列到蛋白質(zhì)庫進(jìn)行查詢,反之亦然。
blast什么意思?
Blast是英語中貝爾實(shí)驗(yàn)室分層時(shí)空的縮寫。它是一種利用多天線系統(tǒng)和多徑傳播效應(yīng)來提高頻譜利用率的新型通信技術(shù)。目前,blast技術(shù)與OFDM(正交頻分復(fù)用)和自適應(yīng)編碼技術(shù)一起被公認(rèn)為3G(超越IMT2000)和4G時(shí)代的三大關(guān)鍵空中接口技術(shù)。