如何進(jìn)行引物設(shè)計(jì)？如果這對(duì)通用引物沒有信號(hào)，就意味著這兩個(gè)位置有SNP，導(dǎo)致沒有擴(kuò)增?？梢詤⒖紟追N方法。1：你可能知道這種細(xì)菌的種類和屬，所以去NCBI找到相關(guān)種類的16S序列，做序列比對(duì)，設(shè)計(jì)簡并引

如何進(jìn)行引物設(shè)計(jì)？

如果這對(duì)通用引物沒有信號(hào)，就意味著這兩個(gè)位置有SNP，導(dǎo)致沒有擴(kuò)增?？梢詤⒖紟追N方法。

1：你可能知道這種細(xì)菌的種類和屬，所以去NCBI找到相關(guān)種類的16S序列，做序列比對(duì)，設(shè)計(jì)簡并引物，擴(kuò)增全長，然后測序。

2：你根本不了解物種。你可以在網(wǎng)上找到更多的入門知識(shí)。最好放大v3v4區(qū)或V4區(qū)。在放大了其中一些之后，你可以對(duì)它們進(jìn)行排序和比較。一般來說，你可以確認(rèn)屬，然后按照1的方法。

3:如果部分序列可以通過方法2擴(kuò)增，但全長引物未能擴(kuò)增，則將獲得的部分序列用作race。

4:以上所有操作均失敗。第二代的DNA被提取和測序，基因組被直接測量（如果你認(rèn)為成本太高，你可以減少數(shù)據(jù)量進(jìn)行比較）。