mega進(jìn)化樹怎么美化 mega7繪制進(jìn)化樹如何設(shè)置顯示進(jìn)化距離?
mega7繪制進(jìn)化樹如何設(shè)置顯示進(jìn)化距離?首先,序列的FASTA格式保存在進(jìn)化樹的TXT文本中,然后打開Meggie 3.1。alignment Explorer/Clustal create a n
mega7繪制進(jìn)化樹如何設(shè)置顯示進(jìn)化距離?
首先,序列的FASTA格式保存在進(jìn)化樹的TXT文本中,然后打開Meggie 3.1。alignment Explorer/Clustal create a new alignment OK no for protein插入文件夾框的右上角。否是將數(shù)據(jù)保存到mega是在mega中打開數(shù)據(jù)關(guān)閉系統(tǒng)發(fā)育鄰居連接樹的第二或第三間隔分支測試圖像另存為EMF格式
mega的全稱是分子進(jìn)化遺傳學(xué)分析。Mega可以用于序列比對、進(jìn)化樹的推斷、分子進(jìn)化速度的估計、進(jìn)化假設(shè)的驗證等,還可以通過網(wǎng)絡(luò)(NCBI)進(jìn)行序列比對和數(shù)據(jù)搜索。打開并選擇alignment—alignment Explorer/cluster,彈出對話框:按提示選擇。在這里,我將選擇第一個“創(chuàng)建新路線”。這里我將根據(jù)我的序列是核酸還是氨基酸來選擇。在這里我將選擇“是”,對話框?qū)⒊霈F(xiàn):日期打開檢索序列從文件,選擇對齊格式文件[Clustal file(。AlN)]在cluster X中:選中后,可以雙擊文件名進(jìn)行修改(如果cluster X的某個版本不能識別原來的FASTA文件名,可以在這里進(jìn)行修改,就像cluster X 1.81的中文版本不能識別某些序列文件名一樣)。修改完文件名后,可以在右鍵菜單中單擊〖刪除簇〗按鈕,保存“當(dāng)前比較結(jié)果”供下次使用。然后,我將添加clusterx程序是集成的。在“對齊”菜單中,選擇“按簇X對齊”。選擇要對齊的序列,然后單擊以打開以下對話框:選擇默認(rèn)設(shè)置,然后單擊“確定”以執(zhí)行對齊。之后,將出現(xiàn)一個轉(zhuǎn)換對話框,顯示兩兩對齊和多序列對齊的過程:等待它運行后,您可以直接保存或刪除它。對話框?qū)⒊霈F(xiàn):選擇是,它將出現(xiàn):輸入一個名稱,如siv-n2,接下來的幾個步驟是類似的。保存后,單擊〖是〗按鈕,系統(tǒng)顯示:當(dāng)序列數(shù)據(jù)界面出現(xiàn)時,注意的主界面發(fā)生了一定的變化,多了幾個功能菜單:在主界面中選擇系統(tǒng)發(fā)育菜單,系統(tǒng)發(fā)育的bootstrap檢驗選擇相鄰連接1000個重復(fù)序列作為bootstrap,選擇核酸p距離作為模型。經(jīng)過計算,我們得到了系統(tǒng)結(jié)構(gòu)樹,如下圖:由kousyouki
Mega進(jìn)化樹如何改變生物的學(xué)名
轉(zhuǎn)到PPT,取消組合,然后它會變成一個單位框,你可以修改字體。
修改后,將它們組合在一起并以TIF格式保存。決議應(yīng)該是可以的。