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java 菌種16sRDNA測序,NCBI比對結果怎么分析?

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菌種16sRDNA測序,NCBI比對結果怎么分析?

首先,打開bioedit軟件,導入拼接樣本序列和標準子類型參考序列

文件新對齊序列新序列導入拼接樣本序列和標準參考序列(使用文本文檔中的復制粘貼工具)應用并關閉以保存結果,關閉窗口

第二步,單擊菜單欄上的“附件應用程序”按鈕,選擇[ClustalW multiple alignment

文件打開附件應用程序ClustalW multiple alignment

第三步:對齊后,刪除對齊序列兩端的冗余序列,使所有序列長度相等

選擇序列要編輯的序列編輯序列編輯序列并保存修改后的結果

第四:選擇“序列”菜單下的“間距”命令,單擊“鎖定間距”按鈕

第五:將對齊的序列另存為FASTA格式的文檔