構(gòu)建進(jìn)化樹里內(nèi)群外群怎么弄？系統(tǒng)發(fā)育樹通常有無根樹和有根樹。如果一棵有根的樹被建造，則需要外類群。所謂外類群是與你所研究的序列密切相關(guān)的序列，外類群可以很好地聚集成一個分支（如果外類群中有多個序列）。

構(gòu)建進(jìn)化樹里內(nèi)群外群怎么弄？

系統(tǒng)發(fā)育樹通常有無根樹和有根樹。如果一棵有根的樹被建造，則需要外類群。所謂外類群是與你所研究的序列密切相關(guān)的序列，外類群可以很好地聚集成一個分支（如果外類群中有多個序列）。如果研究進(jìn)化史，應(yīng)選擇進(jìn)化史早于目標(biāo)序列的序列作為外類群。

建議您看一看這本書：分子進(jìn)化和系統(tǒng)發(fā)育學(xué)，其中詳細(xì)介紹了這方面的內(nèi)容。

一般來說，沒有嚴(yán)格的區(qū)分標(biāo)準(zhǔn)。

細(xì)菌16S rDNA序列分析以后，怎么構(gòu)建進(jìn)化樹？

下載軟件或在線構(gòu)建軟件的方法很多。在線構(gòu)建可以將您的序列輸入PubMed blast n進(jìn)行比較。其中一個結(jié)果是系統(tǒng)發(fā)育樹，但有太多的序列留在它的比較。按相反順序選擇。有很多軟件，最簡單的是DNAStar中的megalin，但結(jié)果很粗糙。建議使用clustalx軟件進(jìn)行同源性比較，然后使用mega3.0軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析，繪制系統(tǒng)發(fā)育樹。這也是非常簡單和容易看到的解釋。Philip系列軟件被普遍認(rèn)為是嚴(yán)謹(jǐn)?shù)?，但其操作是?fù)雜的。